| Bio :: Mcprimers. Bio :: Mcprimers é um módulo Perl para criar pares de primer de polegação molecular para um determinado gene. |
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Bio :: Mcprimers. Classificação e resumo
- Licença:
- Perl Artistic License
- Nome do editor:
- Stephen G. Lenk
- Site do editor:
- http://search.cpan.org/~slenk/Bio-MCPrimers-2.5/lib/Bio/MCPrimers.pm
Bio :: Mcprimers. Tag
Bio :: Mcprimers. Descrição
Bio :: Mcprimers é um módulo Perl para criar pares de primer de PCR de clonagem molecular para um determinado gene. Bio :: Mcprimers é um módulo Perl para criar pares de primer de polegação molecular para um determinado gene para que o gene possa ser direcionalmente inserido em um vetor. Solver é genérico, as enzimas de restrição e sua ordem no vetor são especificadas no chamador.xport Subroutinessub Find_mc_primers $ orf, # ATGC String (eu uso 21 NT upstream, 200 nt downsteam) $ flag_hr, # Referência de hash anônimo a sinalizadores de Mcprimers. PL $ PR3_HR, # Referência de Hash para Primer3 Boulder Arquivo Tags $ ECUT_LOC_AR, # enzima corte de matriz de localização do chamador $ vcCut_loc_ar, # Vector Cut Cating Array referência do chamador @re # Array de restrição enzima cordas de CallerNot Exportado explicitamente. Use Bio :: Mcprimers :: Find_mc_primerssee mcprimers.pl para um exemplo de uso e front-end.installation mcprimers.pm - coloque em lib / bio / mcprimers.pm cloningvector.pm - coloque em lib / bio / dados / plasmídeo / cloningvector Arquivos de vetor de .pm - Faça o diretório de arquivo de vetor Accessable Mcprimers.pl - Place em um diretório onde ele pode ser acessado mcprimers_gui.pl - coloque em um diretório onde ele pode ser acessado McPrimers.Acd - colocar no diretório ACD para gravar apenas verificado com o ACDValidate MCPrimers_Manual.doc - Documentação do usuário MCPRIMER_DIR - Defina essa variável de ambiente para apontar para o diretório contendo a variável de ambiente McPrimers.pl Primer3_dir - definir para apontar para o diretório executável da Primer3. MSWindows - Use Primer3.exe Outros - use os requisitos primer3_core: · Perl.
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