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Bio :: Glifo :: Glyph :: CDS Módulo contém o glifo 'CDS'. Bio :: glyph :: cds módulo contém os "CDs" glyph.synopsis, consulte L e L .Estos Glifos desenham recursos que estão associados a uma região de codificação de proteínas. Em altas ampliações, desenha uma série de caixas que são codificadas por cores para indicar o quadro em que ocorre a tradução. Em baixas magnificações, desenha a sequência de aminoácidos da proteína resultante. Os aminoácidos criados por uma emenda são opcionalmente mostrados em uma cor distintiva.Options As seguintes opções são padrão entre todos os glifos. Veja Bio :: Glifos :: Glyph para uma explicação completa. Opção Descrição Padrão ------ ---------------- -FGColor Primeiro plano Cor Preto -OutinoColor Sinônimo Para -FGColor -BgColor Background Color Turquoise -Flolor Sinônimo Para -BGColor - Largura de linha de linewidth 1 - Altura do cinto de glifo 10 -Font Glifo Fonte GdsmallFont -Conector Conector Tipo 0 (Falso) -Conector_Color Conector Color Black -Label Se para desenhar uma etiqueta 0 (FALSE) -Description Se deve desenhar uma descrição 0 (False) -strand_arrow Seja para indicar 0 (FALSE) Strandedness -Hilite Realite Color Undef (sem cor) Além disso, o alinhamento Glyph reconhece as seguintes opções específicas do glifo: Opção Descrição padrão ------ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --- ------- -Frame0f cor para o primeiro (+) quadro cor de fundo cor -Frame1f cor para segundo (+) quadro quadro cor cor -frame2f cor para terceiro (+) quadro quadro cor -frame0r cor para o primeiro (- Quadro de fundo cor -frame1r cor para segunda (-) quadro quadro cor de fundo -Frame2r cor para terceiro (-) quadro quadro cor cor -gridcolor colo R para o "pessoal "Lightlategray -sixframe desenhe um pessoal de seis quadros 0 (falso; Normalmente, desenha 3 quadro) -Require_subparts Não desenhe o quadro de leitura 0 (FALSE) a menos que seja um subparte de recurso. Mesa de códon para uso 1 (ver Bio :: Tools :: CODONTEBLE) A opção -Require_subparts é sugerida ao renderizar transcrições movidas que contenham várias subpartes CDS. Caso contrário, o glifo irá angústica quando zoom diminuído para um intron entre dois CDs (um quadro de leitura fantasma aparecerá). Para sequências não aplicadas, não * use -require_subparts.Requirements: · Requisitos de Perl: · Perl.

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