Bio :: Alignio :: MSF Bio :: Alignio :: MSF é um módulo Perl com o fluxo de entrada / saída de seqüência MSF.
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Bio :: Alignio :: MSF Classificação e resumo

Bio :: Alignio :: MSF Tag

Módulo Perl. seqüência Fluxo de entrada / saída sequência msf MSF.

Bio :: Alignio :: MSF Descrição

Bio :: Alignio :: MSF é um módulo Perl com o fluxo de entrada / saída de seqüência MSF. Bio :: Alignio :: MSF é um módulo Perl com entrada / saída de saída de seqüência MSF.Synopsisdo não use este módulo diretamente. Use-o através do Bio :: Alignio Class.Este objeto pode transformar Bio :: Alinhar :: Alinhamento de objetos de alinhamento de e para bancos de dados de arquivos simples MSF. O restante da documentação detalha cada um dos métodos de objeto. Os métodos internos são geralmente precedidos a um _next_alntitle: Next_Alnusage: $ ALN = $ stream-> Função Next_Aln (): Retorna o próximo alinhamento no fluxo. Tenta ler * Tudo * MSF Ele lê todos os caracteres não espectados na área de alinhamento. Para MSFs com lacunas estranhas (por exemplo, ~~~) mapá-los usando $ al-> map_chars ('~', '-' - '-') retorna: l objectargs: nonewrite_alntitle: write_alnusage: > Write_Aln (@Aln) Função: grava o objeto $ ALN no fluxo no formato MSF O tipo de sequência do alinhamento é determinado pela primeira seqüência. Retorna: 1 para o sucesso e 0 para erroargs: l Requisitos do Objeto: · Perl.

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