Alinhamento de repetição binária

regiões repetidas em tandem são abundantes em muitos genomas.
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Alinhamento de repetição binária Classificação e resumo

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  • Nome do editor:
  • Lars Arvestad and Peter Savolainen
  • Site do editor:
  • http://www.csc.kth.se/~arve/code/repeatalign/

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Alinhamento de repetição binária Descrição

As regiões repetidas em tandem são abundantes em muitos genomas. As regiões repetidas em tandem são abundantes em muitos genomas. Normalmente não é muito informativo, exceto por várias técnicas de impressão digital usando estatísticas de comprimento, regiões em que as repetições são marcadas, isto é, há pequenas variações da repetição básica, podem ocorrer padrões notáveis. Esses padrões podem ser utilizados para análise evolutiva, como foi demonstrado em (Savolainen et al, 2000a), e análise forense (Savalainen et al, 2000b) se acredita-se que surgem principalmente de slippage de replicação, que faz com que as repetições sejam duplicadas : Uma subsequência é copiada duas vezes durante a replicação e as cópias gêmeas são encontradas próximas umas das outras no produto. Para aproveitar este artefato evolucionário, escrevemos dois programas especiais de computador.


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