Hopedit visualizador de montagem HAPLotype baseado em Java
Baixe Agora

Hopedit Classificação e resumo

Hopedit Tag

php. asp html editor HTML Editor PHP. conjunto Editor ASP. avaliação Sequência de DNA HTML edição haplótipo

Hopedit Descrição

O HapEdit é um instrumento especialmente construído para ajudar o usuário a avaliar a precisão do assembly haplotipo. Isso é feito usando as tecnologias de sequenciamento de próxima geração. O HapEdit é uma ferramenta criada com a ajuda da linguagem de programação Java e pode ser executada em várias plataformas. Principais características: Em vez de uma sequência de consenso Haplóide, os segmentos HAPLotype são exibidos na parte superior da janela de montagem HAPLotype. Uma pontuação de qualidade que avalia a precisão dos segmentos de HaPlotype montados é mostrada abaixo dos segmentos de haplótipo. Um nome de leitura é colorido, refletindo a tecnologia de sequenciamento usada para a leitura. As chamadas base são diferencialmente coloridas de acordo com suas pontuações de qualidade. Isso facilita um usuário para encontrar chamadas base de baixa qualidade. Ao clicar duas vezes em uma região específica na janela de navegação de montagem, um usuário pode ver a visualização detalhada da região exibida na janela do assembly do HAPLotype. Segmentos Haplóticos desassossegados podem ser quebrados em pedaços. A conexão dos segmentos HAPLotype confirmada por dados suplementares é ativada por operações simples do mouse. As taxas de composição de tecnologias de sequenciamento são analisadas e exibidas em gráficos de barras. Da mesma forma, a sequência e a cobertura do clone também são resumidas em gráficos de pizza.

Hopedit Software Relacionado