O aplicativo GA Fuzzy Clustering foi desenvolvido para ser um programa que usa combinação de algoritmo genético e método C-significa para cluster de dados de microarray e dados da matriz de distância. Formato de arquivo de entrada :: - Este programa usa um arquivo de texto simples como entrada. - Todos os itens de dados devem ser separados por tabuladores. - Não são permitidos valores ausentes. MicroArray: - Primeira linha contém nomes de todas as colunas. - Cada linha (começo com o segundo) deve ter o nome do gene (1 coluna ou mais) e os valores de expressão para cada condição. Matriz de distância: - Primeira linha contém legenda (palavra única ou uma string na 1ª posição) e nomes de elementos - Cada linha (começo com o segundo) deve conter o nome do elemento (o mesmo, como na coluna correspondente) e valores de distâncias entre este elemento e os outros. - Matriz é simétrica. - Todos os valores são normalizados (não maiores que 1,0). - Nota: A matriz de similaridade também é permitida. Formato do arquivo de saída: - parâmetros do algoritmo - Distribuição de genes em clusters (se a adesão for> 1 / Nuberofclusters) - Matriz de associação para todos os genes - coordenadas de centros de clusters (nas unidades de expressão gênica)
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