qpure ferramenta para avaliar a telemóvel da amostra do tumor de matrizes SNP
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qpure Classificação e resumo

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SNP.

qpure Descrição

O QPure é desenvolvido como um pacote R acessível e acessível que permite estimar a pureza do tumor ou a celularidade usando dados de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) de amostras de tumor / pareadas normais. As vantagens de usar o método QPure para a estimativa da celularidade do tumor é que é uma abordagem estatística imparcial que mede diretamente o conteúdo do tumor da amostra que o DNA foi extraído. Nosso estudo recente (manuscrito em preparação) sugere que o método QPure é uma ferramenta essencial para estimar a celularidade do tumor antes de realizar seqüenciamento de alta taxa de transferência em amostras de câncer. Esta vinheta dá uma introdução ao estilo tutorial à função no pacote QPure. As funções fornecem a pontuação QPure para cada amostra dada ao seu genômeno-todo SNP Pro Les como gerado de illumina snp chips.

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