massxpert. Um software de espectrometria de massa útil.
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O Massxpert é um aplicativo de espectrometria de massa prático e fácil de usar especialmente projetado para ajudá-lo com suas seqüências de polímeros. Para que o programa seja capaz de lidar com uma variedade de polímeros possivelmente muito diferentes, tinha que ser escrito usando alguma camada de abstração entre o mecanismo de cálculos de massa e a mera descrição da sequência polimérica. Esta camada AB-straction é implementada com a ajuda de \ polymer química de compromissas ", que são les descrevendo precisamente como um determinado tipo de polímero deve se comportar no programa e quais são as suas entidades constitutivas. A forma como a química de polímero é detalhada pela O usuário é o assunto de um capítulo deste livro. No entanto, para dar uma rápida visão geral, aqui está uma situação simples: um usuário está trabalhando em duas seqüências de polímeros, uma de química tipo \ proteína "e outra de química tipo \ DNA". A sequência de proteína lê \ ATGC ", e a sequência de DNA diz \ CGTA". Agora imagine que o usuário deseja calcular a massa dessas seqüências. Como o Massxpert saberá qual fórmula (daí a massa) cada código monomer corresponde a? Lá Deve ser uma maneira de informar a MassXpert que uma das sequências é uma proteína enquanto a outra é um oligonucleotídeo de DNA: isso é feito mediante a criação de uma seqüência de polímero; Os programas solicitam qual tipo de química a sequência a ser criada é. Uma vez que este \ químico parentage "tenha sido de Ned para cada sequência, o Massxpert saberá como lidar com a exibição gráfica de cada sequência e os cálculos para cada seqüência. Principais características: Editor de sequência altamente configurável usando vinhetas monômeros definidos pelo usuário Definição de átomos com qualquer número de pares de massa / abundância isotópica Definição de Brand New Polymer Chemistries Clivagem de sequência de polímero usando agentes de clivagem flexíveis definidos pelo usuário fragmentação de fase gasosa de oligómeros usando regras de fragmentação flexíveis definidas pelo usuário Pesquisa de massa poderosa em uma sequência de polímeros com valores de carga de íons associados intervalos Cópia poderosa / paradigma de pasta permitindo que a sequência de polímero colada seja purificada Cálculo do padrão isotópico de qualquer produto químico a partir de uma fórmula

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