jpredictor.

foi desenvolvido principalmente para a previsão de elementos regulatórios CIS
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jpredictor. Classificação e resumo

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jpredictor. Descrição

O programa JPredictor foi desenvolvido acima de tudo para a previsão de elementos regulatórios CIS. Fragmentos de sequência curta, nomeadamente os locais de ligação do fator de transcrição, são conhecidos por ser enriquecidos e agrupados em tais elementos. Esses locais de ligação são representados como motivos e para a previsão, eles devem ser conhecidos. Usando esses motivos, é possível pesquisá-los em seqüências, para levá-los aplicando um conjunto de treinamento positivo ou negativo (modelo ou plano de fundo, respectivamente) e para marcar uma seqüência.


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