| carnac. Prevendo a estrutura secundária para um conjunto de seqüências de RNA homólogas |
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carnac. Classificação e resumo
- Nome do editor:
- Bonsai Bioinformatics group
- Sistemas operacionais:
- Windows All
- Tamanho do arquivo:
- 309 KB
carnac. Tag
carnac. Descrição
Carnac é uma ferramenta de software para analisar a estrutura secundária hipotética de uma família de RNA homólogo. Observa-se prever se as sequências realmente compartilham uma estrutura secundária comum. Quando essa estrutura existe, o Carnac é então capaz de recuperar corretamente uma grande quantidade de hastes dobradas. A entrada é um conjunto de seqüências de RNA de cadeia simples que não precisam ser alinhadas. A estratégia dobrável depende de um modelo termodinâmico com minimização de energia. Ele combina informações provenientes de elementos localmente conservados da estrutura primária e informações mútuas entre seqüências também com covariações. Obter Carnac e experimente para você ver o quão útil pode ser para você!
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