Webgimm. Ferramenta para realizar análise de agrupamento de genes e amostras
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Webgimm. Classificação e resumo

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Webgimm. Descrição

WebGIMM é uma ferramenta gratuita e fácil de usar para realizar análise de cluster de genes e amostras de dados de microarray e análise de enriquecimento nos resultados do agrupamento. O WebGIMM opera no paradigma do cliente-servidor e descarta o fardo do cálculo da máquina do usuário para nossos servidores. Além disso, sendo baseado no Java Web Start, o WebGIMM pode ser lançado com muita facilidade a partir de um link JNLP, bem como da área de trabalho do usuário e atualizada com novos recursos perfeitamente. Os usuários usam o cliente para carregar seus dados para análise, no qual o cliente exibe uma pequena prévia dos dados para a conveniência do usuário. O WebGIMM também fornece opções para pré-processamento da entrada, se desejado. Os usuários podem especificar os algoritmos de cluster a serem usados, bem como parâmetros apropriados para o mesmo. Uma vez selecionados todas as opções para análise, o cliente envia uma solicitação de computação e os dados para os servidores hospedados pelo laboratório de genômica estatística. Os usuários são fornecidos com atualizações sobre o progresso da computação. Na conclusão do cluster, os usuários podem proceder a realizar análise de enriquecimento nos resultados da análise de cluster. O WebGIMM inclui um treewiew funcional integrado que pode ser usado para visualizar os resultados da análise de cluster e as anotações funcionais associadas. Os usuários também podem baixar os resultados de sua análise do servidor. Disponibilidade de opções para pré-processamento de dados, uma gama de algoritmos de agrupamento, análise de enriquecimento e uma exibição muito bem integrada dos resultados da análise torna a WebGIMM uma ferramenta única de seu tipo.

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