Vista do mar Esta aplicação é capaz de ler e gravar vários formatos de alinhamento.
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Vista do mar Descrição

Seaview é um aplicativo de software projetado especificamente para ajudá-lo a estudar e analisar alinhamentos de seqüência, bem como filogenia molecular. Ele integra habilidades para ler e escrever vários formatos de arquivo, como Nexus, MSF, Clustal, Fastas, Phylip, Mase e Novato. Packagethis portáteis é um programa independente que pode ser executado diretamente no seu computador sem ser instalado de uma maneira que altere suas informações de configuração do Registro do Windows. Você pode armazenar o utilitário em qualquer dispositivo de armazenamento, como drives flash USB. A melhor parte quando você está usando ferramentas portáteis é que você não precisa de privilégios de administrador para executar os programas, pois eles não deixam arquivos ou configurações no computador host. Usuário interfacealthough A GUI não impressiona muito no departamento visual, é realmente prático e fácil de trabalhar. O suporte de arrastar e soltar também está na lista de recursos para que você possa importar rapidamente dados de um arquivo externo. Você pode fazer uso de atalhos de teclado para explorar dados ou pressionar cliques do mouse para selecionar itens e mover sequências selecionadas para outro lugar em um alinhamento. A ferramenta também pode ser executada usando a linha de comando. Importando / exportando OpçõesEside dos formatos de arquivo suportados que foram enumerados na introdução, você pode adicionar informações de vários bancos de dados, como EMBL, Genbank e SwissProt / Uniprot. Além disso, você pode salvar o alinhamento no arquivo atual ou exportação de dados para um arquivo, salvar o alinhamento para o formato de arquivo PDF (você recebe a liberdade de alterar a fonte, o tamanho do bloco e o papel, alterar os sites de variáveis apenas de cor e saída do alinhamento e suas posições). Você tem permissão para adicionar um alinhamento ao final de outro por nome ou classificação. A edição de recursos e opções de alinhamento fornece a você a possibilidade de copiar as seqüências selecionadas para a área de transferência, coletar dados de alinhamento da área de transferência, selecione todas as seqüências do alinhamento, renomeie a seqüência atualmente selecionada, edite comentários, além de alterar uma seqüência externa, além de alterar a sequência externa dados ou abrir dois painéis de seqüência de edição e transferência de informações entre eles. Outras tarefas úteis que podem ser aplicadas às seqüências referem-se a excluir, criar e carregá-las. Além disso, você pode duplicar e inverter-os, executar uma análise de plotagem de pontos, excluir todos os sites de lacuna do alinhamento e definir o código genético para traduzir para proteger a (s) seqüência (s) selecionada (s) selecionada. Quando se trata de ações que ajudam você a gerenciar alinhamentos, você pode executar o alinhamento de destino em todas as seqüências ou selecionadas, sites selecionados ou um perfil (mais especificamente um grupo de seqüências pré-alinhadas). As configurações de configuração e outras ferramentas poderosas permite definir o tamanho da fonte usada para exibir sequências, exibir sequências de DNA como proteínas, use regras de cor para definir as sequências de proteínas, gerar estatísticas sobre composições de seqüência de base ou aminoácidos, a transição e a transversão, especificam o Peças de um alinhamento múltiplo a serem armazenados para análise mais aprofundada, criar e armazenar conjuntos de espécies se o formato Mase ou Nexus for usado, insira linhas de comentários na parte inferior da tela e realize pesquisas. Além disso, você pode calcular, importar, importar e salvar Árvores de DNA ou proteína, enredo, salvar as árvores filogenéticas de impressão e cópia e execute uma análise de "ponto de ponto" de duas seqüências. Linha inferior Tudo somado, o Seaview revela ser um programa avançado para vários alinhamentos de seqüência e filogenia molecular, e é adequado especialmente para usuários de energia. Revisto pela Ana Marculescu, última atualização em 26 de setembro de 2014

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