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O visitante é um aplicativo simples, útil, fácil de usar, especialmente projetado para ajudá-lo com a análise de rede e caminho. O visitante é escrito usando a linguagem de desenvolvimento Java. Principais características: Análise de enriquecimento do módulo de rede (NMEA) para detectar diferença fenotípica entre dois conjuntos de dados (por exemplo, expressão gênica da doença V.S. Normal), experimente NMEA para o caminho do ciclo de célula em dados mutantes p53. A NMEA é delicada para encontrar módulos funcionais que informe as diferenças fenotípicas. Para a liberação atual, essas diferenças são geralmente atividades transcricionais. O NMEA por padrão será realizado para todos os metanodes não embutidos. A função está disponível sob o menu Expression e requer a entrada de dados de expressão (dados de expressão de amostra). Quando a execução da NMEA está completa, os nós nos módulos serão coloridos de acordo com suas pontuações de enriquecimento Vá a Análise de Enriquecimento de Termo (GOTEA) para encontrar os termos de ir mais representados em módulos de rede. A função está disponível sob o menu Metagraph e requer genes nos módulos sendo anotados. Modo de lote automatiza consultas de banco de dados para interações, resoluções de nomes e go anotações, Modo de lote para automatizar processos em lote no fundo e lidar com redes de grande escala com nós de milhões de nós e bordas. Meta-Gráfico: Visualização de Multi-Escala de Redes Bio-redes, Ideal para Rede de Módulos Funcionais, Carregamento rápido do lote de grandes dados de interação definido através da página de estatísticas de interação. Esquema visual flexível da rede: personalizado anotação node eedge, Dados Integrativos-Mineração: 405K + Associações Funcionais (Experimental: 98924, Computacional: 307017) Para 103 espécies, nome Normalização para levedura, voar, homo sapiens etc., Ajustável Alto Desempenho, suporta grande rede, o teste foi realizado com 226k + bordas e nós Fácil HTTP Linking à sua rede e suporte integrado de alta resolução SVG Overlay da expressão da rede / caminho Sistema de Recomendação baseado em dados de expressão integrado para o gene no mesmo caminho / complexo / rede navegação exploratória de vias de KEGG. apoio da rede ponderada usando espessura da borda, ou cor da borda, ou ambos.
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