O Ugene é um conjunto abrangente de análise de genoma que apresenta vários alinhamentos de seqüência e um complexo Módulo Hmm Builder e Search. A Ugene é uma ferramenta útil que também oferece uma experiência de navegação genoma visual e interativa. Também disponível: Ugene portátil Principais características: Alinhamento de seqüência múltipla usando músculo 3 e músculo 4; Perfis HMM constroem e pesquisam, com base na fonte de Hmmer 2 e Hmmer 3; PCR Primers Design usando Primer 3; Previsão de estrutura secundária de proteína usando Gor IV e Psipred; Busca por enzimas de restrição e integração com rebase; Extremamente rápido Repetir Finder; Pesquise sites de ligação ao fator de transcrição usando Sitecon; Orf Finder; completa a implementação do algoritmo de Smith-Waterman. Visualização de cromatogramas; visualizador 3D para arquivos em formatos PDB e MMDB; Múltipla editor de alinhamento de seqüência; Fácil de usar o desenhador de fluxo de trabalho para fluxos de trabalho computacionais personalizados. Suporte completo de processadores multicore modernos e instruções do SSE; Fora do apoio da caixa de gpus modernos usando NVIDIA CUDA e ATI Stream; soluções integradas para o motor de banda larga de célula; Soluções privadas para supercomputadores e computação distribuída.
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