Taxonnerator.

A análise de dados de sequência de código de barras clusteras facilitou.
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Taxonnerator. Classificação e resumo

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Taxonnerator. Tag


Taxonnerator. Descrição

O Taxonnerator é um pacote útil e fácil de usar projetado para ajudá-lo a realizar a anotação simples baseada em similaridade de dados de sequência de código de barras em cluster produzidas pela JMOTU. Ele gera anotação taxonômica para o MOTU, explodindo sequências representativas contra um banco de dados pré-formatado de seqüências de organismos conhecidos (disponíveis deste site). O Taxonnerator é útil para investigação taxonômica inicial de conjuntos de dados de código de barras ambientais. Para cada sequência de banco de dados mostrando semelhança significativa a um motu, as informações taxonômicas são armazenadas em todos os níveis taxonômicos. Isso permite que o usuário final investigue a distribuição taxonômica das seqüências de amostras em vários níveis. Como os dados são armazenados em um banco de dados relacional, eles podem ser consultados usando linguagem de consulta estruturada (SQL) de uma maneira muito flexível ou gravada para arquivos de saída para análise posterior.


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