Statalign. Software para análise Bayesiana de seqüências de proteína, DNA e RNA
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Statalign. Classificação e resumo

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Statalign. Descrição

O Statalign é um aplicativo de código-fonte avançado e aberto projetado para permitir que você execute a análise de DNA. Múltiplos alinhamentos, árvores filogenéticas e parâmetros evolutivos são co-estimados em uma estrutura Markov Chain Monte Carlo, permitindo a medição confiável da precisão dos resultados. Essa abordagem elimina artefatos comuns que os métodos tradicionais sofrem, ao custo do aumento do tempo computacional. Esses artefatos incluem a dependência do filogenia construída em um único alinhamento (provavelmente suboptimal) e viés para a guia guia sobre a qual o alinhamento depende. Os modelos por trás da análise permitem a comparação de seqüências evolutivas distantes: o modelo de exclusão de inserção TKF92 pode ser acoplado a um modelo de substituição arbitrária. Uma ampla gama de modelos para dados de nucleotídeos e aminoácidos está incluída na embalagem e o sistema de gestão do plug-in garante que novos modelos possam ser facilmente adicionados.

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