Sirlama

Ferramenta Java para encontrar seqüências
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Sirlama Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • Freeware
  • Nome do editor:
  • Stijn van Dongen
  • Sistemas operacionais:
  • Windows All
  • Tamanho do arquivo:
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Sirlama Descrição

O Sylamer foi projetado como uma ferramenta baseada em Java para encontrar palavras significativamente sobre ou sub-representadas em seqüências de acordo com uma lista de genes classificada. Normalmente, é usado para encontrar enriquecimento ou esgotamento significativo de seqüências de sementes de MicroRNA ou Sirna de dados de expressão de microarray. O Sylamer é extremamente rápido e pode ser aplicado a conjuntos de dados genômicos com facilidade. Os resultados são plotados em termos de um enredo de paisagem de significância. Essas parcelas mostram perfis de significância para cada palavra estudada através do genelista classificado.


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