Simulador de digestão de proteína. FASTA File Converter e Validator
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Simulador de digestão de proteína. Classificação e resumo

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Simulador de digestão de proteína. Descrição

O Protein Digestion Simulator é um poderoso utilitário projetado para ler um arquivo de texto contendo sequências proteicas ou peptídicas (formato FASTA ou texto delimitado) em seguida, emite os dados para um arquivo delimitado por tabulação. Ele pode opcionalmente digerir as seqüências de entrada usando regras de tripsina ou tripsina parcial e pode adicionar os valores de tempo de eluição normalizados previstos (líquidos) para os péptidos. Ele também pode validar um arquivo FASTA, testá-lo em um conjunto de regras que identificam erros de formatação comuns. Por fim, o programa pode calcular o número de péptidos identificáveis exclusivamente dentro de um arquivo de entrada usando apenas massa, ou tanto em massa quanto em rede, dadas tolerâncias definidas pelo usuário.

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