Simba. Simba - Explore o comportamento do seu gene favorito ou conjuntos de genes
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Simba. Classificação e resumo

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análise gene Genome Análise do genoma análise de genes analisar gene.

Simba. Descrição

O site do Simba Levedura permite a exploração interativa de um compêndio de grande escala de dados de diversas experiências de alta taxa de transferência. Você pode explorar o comportamento do seu gene favorito ou conjuntos de genes, comparar a atividade de vários módulos funcionais em diferentes condições experimentais ou testar as relações entre programas de expressão gênica, interações de proteínas e perfis de ligação do fator de transcrição. O algoritmo de Simba divide genes e propriedades (geralmente um ponto de tempo ou condição em um experimento como microarray de DNA) em clusters ("BICS") composto por genes e propriedades, de modo que os genes se comportam de maneira semelhante nesse grupo de condições. Os BICS podem se sobrepor (em genes, condições ou ambos), e um gene pode estar presente em vários BICS, pois pode ser semelhante a um grupo de genes sob condições A-G e para um conjunto diferente de genes sob condições H-M. Propriedades podem ser qualquer coisa obtida a partir de experimentos genômicos em todo o nível: nível de expressão de RNA, ou não interagem fisicamente, faz ou não interage geneticamente, é ou não é resistente / sensível a um determinado medicamento, etc.

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