Satlotyper. Inferência de HaPlotype de dados SNP unfased em poliploides heterozigóticos baseados em SAT
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Satlotyper. Classificação e resumo

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Satlotyper. Descrição

O Satlotyper é uma ferramenta de software projetada para inferir haplótipos a partir de dados SNP unfásicos policelidais e politelic. O satlotyper usa operadores booleanos e variáveis para formular a inferência de haplótipos por Pure Parsimony (HIPP) para o problema de satisfabilidade booleano (SAT). Para encontrar o conjunto mais parsimonioso de explicar haplótipos, o Satlotyper começa com um assumindo um HaPlotype explicando e aumenta o número de haplótipos até que um conjunto satisfatório seja encontrado. Desde que Sat é NP-completo, não pode ser garantido que uma solução é encontrada em tempo razoável para um determinado dados. No entanto, os testes empíricos mostraram que é possível calcular inferências para dados do mundo real. Além disso, o satlotyper dá restrições para explicar alternativas e é capaz de otimizar a probabilidade de resultado por meio de um procedimento de bootstrap. Dê a satlotyper uma tentativa de ver o quão útil pode ser para você!

Satlotyper. Software Relacionado