Sander 8 Controles de trabalho Preparação do arquivo de controle de trabalho para Sander-8
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Sander 8 Controles de trabalho Descrição

Sander é o módulo âmbar que realiza minimização de energia, dinâmica molecular e refinamentos de NMR. O acrônimo significa recozimento simulado com restrições de energia derivadas de NMR, mas este módulo é usado para uma variedade de simulações que não têm nada a ver com REFINEMENT RMN. A Sander usa namelistas para controlar seus parâmetros gerais de minimização e dinâmica. Namelist fornece entrada dirigida à lista e especificação conveniente de valores padrão. Sander 8 Controles de trabalho é um programa Java escrito para facilitar a preparação de arquivos de controle de trabalho de entrada para Sander-8. Ele usa controles intuitivos para configurar variáveis de controle de trabalho para a Sander Run. Em muitos casos, em vez do nome da variável, ele usa a descrição da variável. Por exemplo, para variável NSTLIM usa "número de etapas MD (NSTLIM)".

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