SEQ-Gen. simula a evolução das sequências de nucleotídeos ou aminoácidos
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SEQ-Gen. Classificação e resumo

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SEQ-Gen. Descrição

A SEQ-Gen foi desenvolvida para ser um programa que simulará a evolução das sequências de nucleotídeos ou aminoácidos ao longo de uma filogenia, utilizando modelos comuns do processo de substituição. Uma variedade de modelos de evolução molecular é implementada, incluindo o modelo general reversível. As frequências do estado e outros parâmetros do modelo podem ser dadas e a heterogeneidade da taxa específica do local também pode ser incorporada de várias maneiras. Qualquer número de árvores pode ser lido e o programa produzirá qualquer número de conjuntos de dados para cada árvore. Assim, grandes conjuntos de simulações de replicadas podem ser facilmente criadas. Ele foi projetado para ser um simulador de uso geral que incorpora a maioria dos modelos comumente usados (e traciais computacionalmente) de evolução da sequência molecular. SEQ-Gen é um programa controlado por linha de comando escrito em ANSI C. Deve ser facilmente compilado e executado em qualquer sistema UNIX ou estação de trabalho. Este artigo descreve o uso de SEQ-Gen em uma máquina UNIX. O aplicativo requer uma quantidade de memória proporcional ao tamanho de cada conjunto de dados de sequência simulados. Running SEQ-Gen Para executar SEQ-GEN, você digita: SEQ-Gen <[

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