Quasirecomb. Gerar e analisar quase aspecas virais submetidas a recombinação.
Baixe Agora

Quasirecomb. Classificação e resumo

Quasirecomb. Tag

inferência Recombinação

Quasirecomb. Descrição

A Quasirecomb é uma aplicação leve que é executada no console de comando, simulando um modelo de Markov para gerar quase quaspecpecies virais. Descreve a geração das quase-quaspecpecies virais e um método para inferir seus parâmetros analisando os dados de sequenciamento da próxima geração. O modelo é validado em dados simulados, mostrando a vantagem de tomar explicitamente o processo de recombinação em conta e testado aplicando as leituras obtidas de amostras experimentais de HIV. Ele oferece uma implementação do algoritmo EM para encontrar a máxima estimativas de posteriori dos parâmetros do modelo e um método para estimar a distribuição de cepas virais nas quasispecias.

Quasirecomb. Software Relacionado