Prottest. Seleção de modelos de melhor ajuste de evolução da proteína.
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Prottest. Classificação e resumo

Prottest. Tag

simulação em forma proteína simulador de evolução evolução alinhamento Identificação de proteína Cristalização Proteína. translocação de proteína. qualidade de ajuste simular evolução analisar evolução Fixação de ajuste Validar proteína regulada evolução dos organismos Evolução Proteína. Teste de proteína. Alinhamento de proteína. dicroísmo de proteína. estruturas de proteína Resíduo de proteína. Navegador de proteína. ver proteína simular a evolução da proteína Simulação de Evolução Proteína. Evolução convergente Evolução paralela Evolução do MKDV. render proteína. Gerenciar banco de dados Protein Protein Vizualizer.

Prottest. Descrição

O Prottest (parente do Modeltest) é um programa para selecionar o modelo de evolução da proteína que melhor ajusta um determinado conjunto de seqüências (alinhamento). Os modelos incluídos são matrizes de substituição empírica (como WAG, LG, MTREV, Dayhoff, Dcmut, JTT, VT, Blosum62, CPRev, RTREV, MTMAM, MTART, HIVB e HIVW) que indicam taxas relativas de substituição de aminoácidos e melhorias específicas (+ I: sites invariáveis, + g: taxa de heterogeneidade entre sites, + f: freqüências de aminoácidos observadas) para explicar as restrições evolutivas impossigidas pela conservação da estrutura e função de proteína. A Prottest usa o critério de informação akeike (AIC) e outras estatísticas (AICC e BIC) para descobrir quais dos modelos candidatos melhor se adaptar aos dados em mãos. Dê a Prottest uma tentativa de avaliar totalmente suas capacidades!

Prottest. Software Relacionado