Prosat. Toolkit de anotação de resíduos de proteína
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Prosat. Classificação e resumo

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anotação Plug-in de anotação anotação SDK Anotação ActiveX. proteína Anotação de vídeo recuperar proteína analisar proteínas proteína comparar Anotação do PDF. Anotação geométrica anotação semântica anotação gráfico molécula de proteína. Biblioteca de anotação processador de anotação anotação de imagem anotação lexical-coesão Anotação semi-automatizada Ouvinte de anotação RECESSY ANOTAÇÃO. Anotação de símbolo de depuração anotação cli. Anotação de texto criar anotação Identificação de proteína Sintetizador de proteína Cristalização Proteína. translocação de proteína. Lista de proteínas Visualização Proteína. ANOTAÇÃO DE SEQUÊNCIA. ferramenta de anotação Anotação numérica Ruby Annotation anotação do site visualizar anotação extração de proteínas processo de anotação transcrição Anotação estruturas de proteína refinamento estrutura de proteína. Características geométricas da proteína. anotação cromossômica anotação genética Anotação de imagem. Anotação de ensaio Atribuir anotação Anotação de código Anotação de áudio Valança de proteína regulada Validar proteína regulada Protein Viewer. resíduo quadrático Não resíduo quadrático resíduo Menos resíduo não quadrático anotação de discurso Mapha de anotação analisador de anotação Anotação intuitiva analisar o banco de dados de proteína. Evolução Proteína. Teste de proteína. Anotação de desenho dicroísmo de proteína. estruturas de proteína Anotação de dados. anotação baseada ontologia Resíduo de proteína. Resíduo aminoácido. SVM Builder anotação funcional Sistema de anotação de cDNA. avaliar o complexo de proteína. Previsão complexa de proteína. Veja o complexo de proteína. por cento de resíduos resíduo de aminoácido. Navegador de proteína. Prepare a anotação da estrutura Banco de dados de proteína Brookhaven Editor de anotação ver proteína arquivo de proteína vista analisador de proteína. Anotação do vento do mundo exibir anotação fazer anotação colocar anotação Anotação de mapa Controle de anotação sequências de proteína vista Viewer de sequências de proteína. anotação de nucleótidos simular a evolução da proteína Simulação de Evolução Proteína. alinhar proteína. Visualize proteína. Proteína mascote. Anotação máxima Interação proteína render proteína. arquivos de proteínas vista Gerenciar banco de dados Protein Protein Vizualizer. Estrutura de proteína 3D. remoção de anotação ANOTAÇÃO KODAK. como jogar xHarbour ActiveX XLS para DTD. divx codec linux. controlador de vídeo toshiba. Canções de karaokê para descongelhar 7,00.020.3172. Label de CD de Zweckform AutoCAD 2008 para baixo iso r773 pdf.

Prosat. Descrição

O prosat Toolkit foi desenvolvido para ser um conjunto de programas que permitem a construção de modelos baseados em SVM para anotação de resíduos de aminoácidos em seqüências de proteínas usando recursos fornecidos pelo usuário (como perfis psi-explosivos ou perfis psipridos). Em particular, o Toolkit constrói recursos usando uma janela ao redor do resíduo e está equipado com uma função de kernel especializada (função de kernel exponencial de segunda ordem normalizada NSOE), juntamente com a função padrão do kernel SVM. prosat_learn é o programa para aprender "n" modelos de classificação de um versus-repouso, onde n são o possível número de anotações. Também pode aprender um suporte de regressão de vetor de suporte para prever um valor de ponto flutuante. Uso Prosat_learn Prosat_predict é o programa para prever a anotação para cada resíduo dos modelos construídos e produzir um perfil de dimensão L XN, emitindo a pontuação de cada um dos n um versus Os modelos de repouso SVM para cada resíduo de aminoácidos e l é o comprimento da sequência proteica. No caso de um modelo de regressão, n = 1. Uso Prosat_predict. entrada Prosat_predict tem três parâmetros necessários: - Arquivo de teste: O arquivo de teste fornece a lista de recursos de sequência para os quais precisamos prever os perfis de anotação. É semelhante ao arquivo de entrada usado em prosat_learn, exceto que não contém os nomes dos arquivos de anotação verdadeiros, já que estamos prevendo o mesmo. - Arquivo modelo: O arquivo do modelo é o arquivo de modelo que foi enviado por Prosat_learn - Arquivo de Previsão: O arquivo de previsão fornece o caminho e o prefixo das previsões de saída na forma de perfis de anotação. saída A saída consiste em um conjunto de anotações e perfis previstos, que não são nada além das previsões do SVM de cada um dos modelos SVM "Num Element".

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