| Priorseditor Analise seqüências de DNA com esta ferramenta. |
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Priorseditor Classificação e resumo
- Nome do editor:
- Kjetil Klepper
- Sistemas operacionais:
- Windows All
- Tamanho do arquivo:
- 2.1 MB
Priorseditor Tag
Priorseditor Descrição
O PriorSeditor é um trabalho útil, fácil de usar especialmente projetado para ajudá-lo com a análise da região reguladora e a descoberta de local de ligação do fator de transcrição. O programa enfatiza o uso de priores posicionais para focar a busca por sites de ligação para partes de seqüências de DNA que são consideradas mais propensas a conter sites funcionais verdadeiros. As faixas de Posicionais podem ser construídas pela manipulação, comparando e combinando informações sobre várias características, incluindo, por exemplo, conservação filogenética, sítios hipersensíveis de dnase, regiões repetidas, posições de nucleossoma e outros dados epigenéticos, propriedades físicas da hélice de DNA, a distância do local de início da transcrição, proximidade de outros locais de ligação conhecidos e muito mais. Os dados podem ser baixados no navegador Genome UCSC (ou importado do arquivo) e visualized com a interface gráfica do usuário. Também é possível realizar a descoberta de Novo Motif ou a varredura de motivos com modelos de motivos conhecidos, intercing que interface com programas instalados localmente. Os resultados podem então ser visualizados, analisados e pós-processados dentro do Priorseditor.
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