Primerplex. Primerplex é uma ferramenta eficiente e sofisticada para projetar oligos.
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Primerplex. Classificação e resumo

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Primerplex. Descrição

Primerplex é uma ferramenta eficiente e sofisticada para projetar oligos para ensaios multiplex. Os ensaios multiplex facilitam a amplificação de múltiplos alvos em um único vaso de reação, reduzindo tanto o tempo quanto o custo da experimentação. Primerplex projeta oligos para ensaios de PCR multiplex e para sistemas baseados em matriz de suspensão, como Luminex 100, Luminex 200 e Bio-Plex 200. Esses sistemas oferecem uma plataforma versátil para detecção de ácido nucleico multiplexada em um formato de 96 poços. Os ensaios multiplexes são usados para análise de expressão gênica (detecção de ponto final usando eletroforese de gel) e para aplicações de alta taxa de transferência SNP, tais como genotipagem, detecção de patógenos, digitação de estirpe e haplotipagem. Para garantir a especificidade, os oligos são projetados após evitar as regiões das homologias identificadas por uma busca de explosão. Primerplex então verifica os oligos para a reatividade cruzada e minimiza as incompatibilidades da TM para dar-lhe o melhor conjunto multiplex possível. No processo, analisa milhões de possíveis conjuntos de primer multiplex em alguns segundos e apresenta uma lista de conjuntos alternativos para você também. Primerplex projeta primers padrão para um ensaio de PCR multiplex 30-Plex. Ele usa algoritmos proprietários para projetar conjuntos de primers ideais sob condições de reação uniforme para até 30 alvos. Os conjuntos de primers são identificados após a triagem de todos os primers em um pool e minimizando as incompatibilidades da TM. Todos os conjuntos de primeiros multiplex são analisados para hibridação cruzada para garantir uma amplificação específica e alta intensidade de sinal.

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