Organizador de genoma viral.

Browser Genome para usar via Java
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Organizador de genoma viral. Classificação e resumo

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  • Viral Bioinformatics
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Organizador de genoma viral. Tag


Organizador de genoma viral. Descrição

Organizador do genoma viral ou VGO criado para ser um navegador genoma com base em java fácil de usar. Pode ser usado para exibir informações sobre um genoma, incluindo seus genes, orfs e códons de partida / parada. Também pode ser usado para realizar uma pesquisa de expressão regular, uma pesquisa de motivo fuzzy e uma pesquisa de Masslist. Como a VGO fala com nosso banco de dados de seqüências genômicas (VOCs), pode ser usado para comparar genomas. Principais características: Ver genes e previu orfs em uma ou uma série de genomas. Display Iniciar e parar os códons dentro da sequência Busca por seqüências dentro dos genomas usando expressões regulares; e.g ggatcc ou ttttt t usando um padrão de pesquisa difusa; por exemplo. GGATCC permitindo uma incompatibilidade para genes com a mais alta na composição Use uma GUI para selecionar e extrair regiões de um genoma exibir ortolologos em um conjunto de genomas usando a GUI para selecionar um gene em outro genoma exibir um enredo de composição de nucleótidos. Procurar o mais longo oligonucleótido compartilhado entre uma série de genomas desalinhados Pesquise o genoma traduzido para correspondências para ptidos de especificação de massa Exibir graficamente dados de outros programas em cima do visor do genoma


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