Mrbayes.

Uma ferramenta para ajudá-lo com sua estimativa bayesiana de filogenia.
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Mrbayes. Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • GPL
  • Nome do editor:
  • Sebastian Hoehna
  • Sistemas operacionais:
  • Windows All
  • Tamanho do arquivo:
  • 494 KB

Mrbayes. Tag


Mrbayes. Descrição

Mrbayes é uma aplicação simples e fácil de usar especialmente projetada para a estimativa bayesiana de filogenia. O programa leva como entrada de uma matriz de caractere em um formato de arquivo Nexus. A saída é vários arquivos com os parâmetros que foram amostrados pelo algoritmo MCMC. Mrbayes pode resumir as informações nesses arquivos para o usuário. Principais características: uma interface comum de linha de comando para sistemas operacionais Macintosh, Windows e UNIX; Ajuda extensa disponível através da linha de comando; Capacidade de analisar o nucleotídeo, aminoácido, local de restrição e dados morfológicos; mistura de tipos de dados, como caracteres moleculares e morfológicos, em uma única análise; Um método geral para atribuir parâmetros entre partições de dados; uma abundância de modelos evolutivos, incluindo modelos de 4 x 4, doublet e códon para dados de nucleotídeos e muitas das matrizes de taxa padrão para dados de aminoácidos; Estimativa de sites positivamente. Selecionados em uma estrutura de Bayes totalmente hierárquicas.


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