MrModeltest. C programa para selecionar modelos de substituição de DNA usando paup
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MrModeltest. Classificação e resumo

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MrModeltest. Descrição

Comparar diferentes modelos de Evolução do DNA é uma tarefa reservada para um determinado conjunto de usuários, que têm o conhecimento necessário para extrair informações úteis. Eles também precisam de ferramentas específicas para conduzir a operação e o MrModeltest é um utilitário projetado especificamente para o trabalho. O aplicativo de tecla de comando-prompt não precisa ser instalado e é baseado em console. Isso pode distanciar parte do usuário, embora seja lançado, apresenta as instruções adequadas sobre o uso e os comandos e argumentos suportados. O desenvolvedor informa que a ferramenta emprega testes de razão de probabilidade e AIC (AKIKE Information Criterion), que mede uma qualidade relativa de um modelo estatístico para dados específicos. Detalhes adicionais fornecidos pelo desenvolvedor referem-se à quantidade de modelos de substituição de nucleotídeos suportados pelo aplicativo, que é definido como 24, e todos eles podem ser especificados na ferramenta Mrbayes (utilizados para a estimativa bayesiana de filogenia). Lista de comandos suportadosPito Uma interface gráfica do usuário, funcionar com o MrModeltest pode não ser muito difícil para os usuários que ele alvo, já que a janela do console mostra a lista de comandos suportados. O programa permite selecionar a hierarquia HLRT2 / 3/4, além de definir os níveis alfa e depuração. Exemplos são apresentados na tela para facilitar as coisas. Há também a possibilidade de habilitar o modo AIC ou o LRT Calculator e definir o número de táxons. Para a maioria das operações, há dicas de ferramentas adicionais que podem ajudar o usuário. Comparar DNA Evolution ModelsmrModeltest é um garfo do aplicativo modeltest que suporta quase o dobro do número de modelos de substituição de nucleotídeos. Mas sua vantagem é que estes podem ser implementados na utilidade Mrbayes para estimativa de filogenia. Revisto por Ionut Ilascu, Última atualização em 2 de junho de 2014

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