Modeltest. Uma ferramenta para selecionar o modelo de melhor ajuste de substituição de nucleotídeos
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Modeltest. Classificação e resumo

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Substituição de URL seleção Substituição de texto substituição proporção de nucleótidos TrichView Substitution. substituição Cipher cifras mudança de substituição sequência nucleotídica. Gerenciador de seqüência de nucleótidos nucleótido Substituição parcial Substituição da unidade Substituição monoalfetária Modelo de substituição de nucleótidos motivo de nucleotídeo modelo complexo de substituição Substituição de nucleótidos Framework de seleção de modelos probabilidade hierárquica anotação de nucleótidos Modelo de substituição de DNA. Os alinhamentos de nucleótidos Modelo de DNA de Substituição. sinônimo Substituição Substituição nonsynonymous modelo de substituição polimorfismos de nucleotídeos. mutação nucleótida fração de nucleotídeos

Modeltest. Descrição

O Modeltest é um software avançado e confiável desenvolvido para servir engenheiros genéticos na determinação das diferenças entre os modelos de substituição de DNA usando testes hierárquicos de hipótese para gerar os resultados. Interface de linha de comando A aplicação é bastante complexa, uma vez que significa para usuários experientes com um sólido conhecimento de fundo em genética, bem como computadores, especificamente, uma vez que não fornece aos usuários uma GUI, executando apenas através da interface de linha de comando, que pode torná-lo bastante desafiador para novatos. No entanto, o Modeltest não requer instalação, portanto, é suficiente para os usuários apenas soltar o arquivo executável em uma instância aberta de prompt de comando e pressione a tecla ENTER, que por sua vez revelará as funções do programa, juntamente com uma breve explicação dos comandos disponíveis. funções e parâmetros em execução O ModelTest é destinado a trabalhar com arquivos gerados pelo PAUP * que contêm as informações genéticas necessárias, bem como arquivos que compõem pontuações de registro bruto, juntamente com estimativas de parâmetros para os modelos avaliados. Na extremidade oposta, o utilitário gera uma descrição dos testes de taxa de probabilidade realizados, e seus correspondentes valores de P, informações que são então interpretadas e atribuídas a um modelo adequado. Os modelos suportados são listados na interface de linha de comando, incluindo JC (Jukes e Cantor), TRNEF (Tamura-Nei com freqüências de base igual), TIM (Modelo Transitório), GTR (Tempo Geral Reversível), F81 (Felsenstein) e vários . Ao mesmo tempo, os usuários podem trabalhar com um conjunto específico de funções, exemplificado na janela principal, a fim de facilitá-los a entender e empregar. Como tal, os usuários podem determinar o nível de depuração (-d), o nível alfa (-A), o número de táxons (-t), ativar o modo LRT Calculator (-L), determinar o intervalo de confiança para a média (-W) ou use BIC em vez de AIC para todas as operações futuras (-B). Um instrumento abrangente para determinar o modelo de substituição adequado Para concluir, o modeltest é uma aplicação eficiente desenvolvida para profissionais que trabalham no campo da genética, oferecendo-lhes os meios de comparar modelos de substituição de DNA, ajudando assim os usuários a que melhor se adapte aos seus dados.

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