A MetaPiga é uma ferramenta poderosa projetada para oferecer uma implementação robusta de várias heurísticas estocásticas para grande inferência de filogenia. O programa inclui um algoritmo de recozimento simulado, um algoritmo genético clássico e o algoritmo genético de metapopulação (Metaga). As ferramentas disponíveis também incluem modelos complexos de substituição, heterogeneidade de taxa gama discreta e possibilidade de partição de dados. A interface fornece acesso rápido às principais funções e suporta o processamento em lote.
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