Mesa. permite que os conjuntos de dados seja manipulado de maneiras sofisticadas
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Filogenias são armas de fumo. Uma história evolutiva continua em sua forma de forma as impressões digitais de todos os processos que efetuam sua criação: extinções, adaptações-chave, radiações, colonizações, mudanças no ritmo e modo de macroevolução. Infelizmente, analisando filogenias é difícil. Os cálculos de interesse para qualquer investigador são às vezes intrincados e trabalhistas intensivos. Eles também são muitas vezes em vários programas, se houver uma implementação de software. O significado estatístico dos resultados geralmente exige a comparação de centenas de milhares de árvores. Finalmente, as métricas podem ser frágeis para o modo de evolução que um filogenia cresceu. O resultado desses problemas é que a análise filogenética é muitas vezes trabalho árduo, e é difícil saber o que fazer as respostas. O aplicativo MESA foi projetado para aliviar esses problemas. Embora a Mesa realmente faça quatro coisas, a grande vitória para os investigadores é que tudo isso é no pacote de um software e pode ser usado em conjunto entre si e semi-automatizado. Assim, os problemas de transferência de dados entre programas e possíveis corrupção ou má sensação de resultados são evitados. Principais características: Manipulações: Mesa permite que os conjuntos de dados sejam manipulados de maneiras sofisticadas. Árvores filogenéticas e traços de história de vida podem ser editados, duplicados ou excluídos. Branches podem ser sistematicamente modificados, a taxa excluída de acordo com condições complexas, traços modificados globalmente e seletivamente. O conjunto de dados inteiro também pode ser feito de backup e restaurado a qualquer momento. Análises: Mesa incorpora um grande número de cálculos que podem analisar a diversidade dentro de uma filogenia (por exemplo, diversidade filogenética), diversidade entre as comunidades (por exemplo, índice Shannon-Weiner), medidas de processo macroevolutivo (por exemplo, desequilíbrio Fusco-Cronk) e reúne informações seletivamente através do táxu (por exemplo, Simulações: Mesa permite que os filogenios sejam cultivados sob cenários sofisticados, onde as taxas de especiação e extinção podem ser efetuadas pelas características dos táxons envolvidos ou atributos globais da filogenia. Simulações podem ser adornadas por extinções em massa e a evolução dos traços de história da vida. Automação: Para permitir a produção e teste de um grande número de filogenias, a Mesa permite que os usuários construam cadeias de ações (manipulações, análises e simulações) que podem ser executadas como uma única unidade, looping sobre grupos de comandos, economizando e restaurando dados. Assim, pode-se facilmente gerar um grande número de repetições para validade estatística.

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