Mcheza. detectar marcadores dominantes com este aplicativo java
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Workbench marcador

Mcheza. Descrição

MCHEZA foi desenvolvido como uma bancada de detecção de seleção de código aberto e aberto para marcadores dominantes. Compreender a contribuição da seleção e adaptação molecular na modelagem de ampla variação do genoma tem muitas aplicações que vão desde a saúde humana à conservação de espécies ameaçadas de extinção. O MCHEZA fornece uma plataforma integrada para testar marcadores dominantes para seleção. O aplicativo mescla o kernel DFDIST, um método de fST-outlier amplamente utilizado para detectar a seleção com uma interface inteligente e fácil de usar. Principais características: DFDIST - O núcleo da MCHEZA é uma versão dominante de um método de outlier de FST amplamente utilizado para detectar a seleção. Suporte para correção multitestas com base em taxas de descobertas falsas (FDR). A correção multitestest é fundamental para evitar alta superestimação da porcentagem de outliers. Java Web Start Application com uma interface fácil de usar, diretamente utilizável da web. Importação de dados no formato Genepop. Exportar dados para software de planilha R ou comumente usado. capacidade de escolher quais populações e / ou loci são estudados. Aproximando a média métrica do FST removendo o potencial selecionado loci. Aproximando a média simulada do valor médio encontrado no conjunto real, mesmo quando as condições experimentais estão longe daquelas onde a fórmula teórica detém (por exemplo, baixo número de demas ou o uso do modelo de mutação stepwise). alisamento iterativo de contornos de intervalo de confiança. Geração de gráficos de qualidade de publicação em vários formatos (PNG, SVG e PDF) Capacidade de usar vários núcleos de CPU ao executar o DFDIST.

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