Malva

malva - vários alinhamento de seqüência genoma. Comparação de seqüência do genoma.
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Malva Classificação e resumo

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  • Aaron Darling
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Malva Descrição

O malva é um sistema para construir eficientemente os vários alinhamentos do genoma na presença de eventos evolucionários em larga escala, como rearranjo e inversão. O alinhamento genoma múltiplo pode fornecer uma base para pesquisa em genômica comparativa e o estudo da dinâmica evolutiva em uma escala totalmente nova. Alinhando genomas inteiras é um problema fundamentalmente diferente do que alinhar sequências curtas. O MAUVE foi desenvolvido com a ideia de que um alinhador de genoma múltiplo deve exigir apenas recursos computacionais modestos. Emprega técnicas algorítmicas que estão bem na quantidade de seqüência sendo alinhada. Por exemplo, um par de genomas de Y. Pestis pode ser alinhado em menos de um minuto, enquanto um grupo de 9 genomas enterobacterianos divergentes pode ser alinhado em poucas horas.


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