Imas.

Visualizar e analisar informações genômicas com a ajuda desta aplicação.
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Imas. Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • GPL
  • Nome do editor:
  • Chris Shaw
  • Sistemas operacionais:
  • Windows NT / 2K / XP / Vista
  • Tamanho do arquivo:
  • 26.8 MB

Imas. Tag


Imas. Descrição

O IMAS ou o sistema interativo de análise multigenômico é um novo sistema de analítica visual projetado especialmente para a descoberta de conhecimento em informações genômicas. O IMAS permite que os cientistas genômicos analisem rapidamente um conjunto de sequências genômicas microbianas usando ferramentas como vislumbre, explosão, clustalw, primer3 e transferência e visualizar a saída dessas ferramentas em uma estrutura genômica unificada. O IMAS fornece ao usuário uma interface gráfica de zoom de 1 dimensional para uma sequência genômica. O usuário pode interagir com a sequência para analisar a presença de regiões de codificação, que podem ser analisadas por alinhamento de seqüência com bancos de dados locais e remotos usando a explosão. Os resultados da explosão são exibidos em uma estrutura gráfica unificada que permite ao usuário filtrar e selecionar ativos de juros. Os hits de explosão selecionados podem ser então multializados usando Clustalw e essas multialimações são exibidas usando a estrutura gráfica comum. Multialimações e alinhamentos de pares podem ser anotados pelo usuário para referência futura e relatórios HTML podem ser gerados mostrando essas descobertas. Principais características: interface de usuário zoomable - rápido! Executa programas de análise localmente (explosão, glimmer, clustal ...) imas blast pode procurar banco de dados ncbi nr executa hmmpfam na cópia local dos dados da PFAM Pode criar DBS da explosão dos arquivos XML Insdseq


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