Hapeevolution. detecta interações gene-gene de dados de HaPlotype de controle de caso
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Hapeevolution. Classificação e resumo

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Hapeevolution. Descrição

Doenças complexas envolvem vários genes com baixa penetração que podem ser distribuídos pelo genoma. A maioria dos métodos atuais de associação HAPLotype são tipicamente restringidos de comprimento e consistem em alelos de SNPs contíguos. Essas abordagens têm capacidade limitada para detectar epistasis de várias interações genéticas. Evidência recente mostrou que a estrutura 3D de cromossomos pode desempenhar um papel na permissão de SNPs interagir com elementos genéticos fisicamente separados pela grande distância. A HapEvolution é uma aplicação profissional destinada a implementar um algoritmo coobitário cooperativo (CCA) para detectar interações genéticas genéticas de dados de haplótipo de caso-controle; Além disso, este algoritmo pode tolerar até 15% de posições faltantes / ambíguas nos dados de Haplótipo decorrentes durante o fase de genótipos. Além disso, o algoritmo pode calcular associações epistáticas de genes que abrangem vários cromossomos.

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