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Bowtie é um software de alinhamento de leitura curto eficiente de memória, projetado para alinhar seqüências de DNA curtas (leituras) ao genoma humano a uma taxa de cerca de 25 milhões de leituras por hora em uma estação de trabalho típica com 2 gigabytes de memória. Agora, você pode usar essa ferramenta baseada em linha de comando para alinhar rapidamente suas seqüências de DNA. Você também pode criar arquivos em lote para executar as operações que exigem vários parâmetros. Bowtie também suporta os modos de alinhamento local, jogados e emparelhados.

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