Ferramenta mágica

MicroArray Genome Imaging and Clustering Tool
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Ferramenta mágica Classificação e resumo

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  • Rating:
  • Licença:
  • GPL
  • Nome do editor:
  • Laurie Heyer
  • Sistemas operacionais:
  • Windows All
  • Tamanho do arquivo:
  • 17.1 MB

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Ferramenta mágica Descrição

A Ferramenta Mágica é um aplicativo Windows baseado em Java cujo objetivo é ajudá-lo a analisar arquivos TIFF microarray DNA e processar dados comparativos de hibridização (chips de vidro) e Affymetrix Information.Porable Running Modeyou pode aproveitar o fato de que a ferramenta chegar em um pacote portátil e implantá-lo diretamente no seu computador sem ter que passar por um processo de instalação. Além disso, seu registro do Windows não é inchado com entradas desnecessárias. Você pode armazená-lo em qualquer unidade flash USB ou outros dispositivos e levar você. A ferramenta interfacemagic do usuário adota um layout limpo que permite adicionar arquivos no ambiente de trabalho usando o botão Browse (não há suporte para arrastar e soltar). Você pode visualizar o conteúdo do arquivo, explorá-lo usando as funções de zoom e out, ajuste a imagem para a tela, defina os pontos superiores esquerdo e direito, especifique a linha inferior, bem como ajuste o número de linhas e colunas. Definindo novos projetos O aplicativo faz uso de projetos para armazenar detalhes e configurações sobre os dados importados e executou cálculos. Os projetos podem ser salvos e adicionados para futuras tarefas de edição. Você pode importar itens com diferentes formatos de arquivo (TXT, JPEG, TIF, GIF, Grade, Info ou Flag), adicionar o conteúdo de uma pasta inteira, inserir arquivos na pasta do projeto e atualizar o projeto (os ajustes são aplicados automaticamente), Além de carregar os pares de imagens tiff vermelhas e verdes. Além disso, você pode carregar a lista GENE e criar uma nova grade ou adicionar um salvo. Quando se trata de criação de grade, você pode inserir o número total de grades no arquivo TIFF, especificar a orientação do ponto dentro das redes (horizontalmente ou verticalmente), ajuste o contraste para ajudar a iluminar pontos fracos, Center Atual Grade, inserir informações de localização da grade Usando três cliques (Configurando os pontos superior esquerdo e direito, e linha inferior), ajuste a grade aos pontos do centro, crie várias grades e sinalize manchas problemáticas (opcionalmente). Distinguir sinal de ruído, gerar uma série de clusters e ferramenta Moremagic fornece a possibilidade de distinguir o sinal do fundo e gerar arquivo de expressão. Você pode escolher entre diferentes métodos para distinguir o sinal de fundo, nomeadamente círculo fixo ou adaptativo, opção de crescimento da região semeada (projetado para encontrar o sinal para cada local com base na distribuição do sinal), ou métodos de proporção ou plano de fundo ou verde Primeiro plano e fundo, a fim de determinar a proporção para cada recurso no microarray). Além disso, você pode repetir várias etapas para condições experimentais em seu estudo, manipular dados (transformar, normalizar, limitar dados, filtrar ou scramble), adicionar informações gerais ao arquivo de expressão, filtrar seus dados removendo genes desnecessários, calcular dissimilaridades (medindo As diferenças entre todos os pares de padrões de expressão gênica), geram uma série de clusters, construam uma lista de tarefas a serem executadas em seqüência e compare as conseqüências de diferentes escolhas para quantificar, comparar e agrupando o mesmo conjunto de dados bruto. O Lineall inferior em tudo, a ferramenta mágica prova ser uma ferramenta confiável que pode ser usada como um poderoso instrumento educacional para ajudar os alunos a explorar e processar arquivos TIFF microarray DNA. Avaliado por Ana Marculescu, última atualização em 20 de outubro de 2014


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