ErmineJ. Analisar genes com este aplicativo.
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ErmineJ. Classificação e resumo

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analisador análise expressão expressão genetica gene analisar a aplicação conjuntos. Analisar gene set. encontrar conjunto gene. Extrair subconjunto genético Buscador de subconjunto genético Grab Gene Subet ver dados do gene. exibir dados do gene. analisar a expressão gênica correlação genética Correlate gene. analisar gene. Organização Gene visualização do gene. Compare gene Comparador de genes padrão de gene gene candidato simular mutação genética adjacência do gene. anotação genética banco de dados Gene Ontology Ontologia do gene Criar rede genética gerador de rede genética Informações do gene associação de produtos genéticos associação de doenças genéticas Tradutor de identificadores de genes. Previsão de função genética identificação de genes analisar estrutura genética analisador de estrutura do gene mapeador de genes. comparação ordem do gene comparar a ordem dos genes Conteúdo genético derivado Analise gene de codificação de proteína seleção de genes. Analisar conjuntos de dados genéticos analisar sequência do gene 16S rRNA Cluster de gene ancestral calculadora de agrupamento genético gene ancestral cluster de genes analisar dados genéticos Análise de dados genéticos. Dados de micro-array de expressão Analise os marcadores do gene transferência genética simular rede de genes crescendo duplicação genética Analisar dados de frequência de genes estimar diversidades genas Teste gene diversidades Diversidade Genética Seqüência genética Interação genética Nome da seqüência de genes confiabilidade dos clusters genéticos Analise o gene modificador mapear o gene da doença visualize gene. Explore Gene. ver gene.

ErmineJ. Descrição

O Erminej é uma ferramenta acessível e fácil de usar para ajudá-lo a realizar análises de conjuntos de genes em dados de micro-array de expressão ou outros dados genômicos que resulam em rankings de genes. Um objetivo típico é determinar se particulares caminhos biológicos estão "fazendo algo interessante" nos dados. O software é projetado para ser usado por biólogos com pouco ou nenhum fundo informático. Principais características: Implementação de múltiplos métodos para análise de conjunto de genes: análise de excesso de representação Um método baseado em reamplagem que usa pontuações gênicas Um método baseado em classificação que usa pontuações gênicas Um método baseado em reamplagem que usa correlação entre os perfis de expressão gênica (um tipo de análise de "enriquecimento de cluster"). Os conjuntos de genes recebem pontuações estatísticas (valores de p) e várias correções de teste são suportadas. apoio da terminologia de ontologia genética; Os usuários podem escolher quais aspectos analisarem. Arquivos de usuário usam formatos de texto simples. Os usuários podem modificar conjuntos de genes ou criar novos. Os resultados podem ser visualizados dentro do software. É simples comparar várias análises do mesmo conjunto de dados com diferentes configurações. Os hiperlinks definidos pelo usuário são fornecidos a sites externos para permitir uma navegação mais eficiente dos resultados. Para programadores, há uma interface de linha de comando, bem como uma interface simples de programação de aplicativos que pode ser usada para conectar a funcionalidade Erminej em seu próprio código

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