Embl / Fasta Wrapper para WebSphere Information Integrator

Uma ferramenta que permite o acesso, a recuperação e a federação de seqüências bio-seqüências e dados armazenados em fontes de dados especializadas, em formato embl ou FASTA
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Embl / Fasta Wrapper para WebSphere Information Integrator Classificação e resumo

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  • IBM Corporation
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Embl / Fasta Wrapper para WebSphere Information Integrator Tag


Embl / Fasta Wrapper para WebSphere Information Integrator Descrição

Uma enorme quantidade de dados bioinformáticos está atualmente armazenada dentro de arquivos planos em numerosos bases de dados especializados, tanto públicos quanto privados, estabelecidos nas últimas décadas por instituições de pesquisa e laboratórios em todo o mundo. Acessando informações armazenadas em tais bancos de dados não é uma tarefa trivial porque são necessárias ferramentas e algoritmos bioinformáticos específicos. Além disso, essas ferramentas geralmente expõem interfaces não padronizadas e idiomas de consulta que dificultam essas atividades como integração ou interoperação dessas fontes de dados. Entre as dezenas de formatos para seqüências de proteína e DNA armazenadas em arquivos planos, a EMBL e FASTA certamente são amplamente utilizados. Embl / Fasta Wrapper para WebSphere Information Integrator Permite aplicativos, bem como os usuários para recuperar seqüências de proteína e DNA e dados armazenados em bancos de dados de arquivos planos no formato EMBL ou FASTA usando o SQL como a linguagem de consulta. Graças aos principais recursos fornecidos pelo WebSphere Information Integrator e este wrapper não relacional, os usuários podem praticamente "trazer" dados EMBL / FASTA em seus bancos de dados federados para não apenas consultar um único banco de dados de arquivos planos, mas para compor "consultas federadas" "Na verdade, resolvido contra fontes de dados relacionais e não relacionais. Embl / Fasta Wrapper para WebSphere Information Integrator permite o manuseio de fontes de dados de arquivos planos, pois os bancos de dados relacionais são tratados (por exemplo, a instrução SQL like é suportada para consultar partes de não-sequência de entradas EMBL e FASTA.) Dê um wrapper EMBL / FASTA para o WebSphere Information Integrator A tentativa de avaliar plenamente suas capacidades!


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