O DUPTREE é um aplicativo pequeno, fácil de usar, prompt de comando especialmente projetado para ajudá-lo a realizar análise de parsimône de árvore genética em larga escala. O programa implementa um romance algoritmo que melhora significativamente o tempo de execução das heurísticas de busca padrão para a parsimony de árvore genética, e permite as primeiras análises filogenéticas da primeira escala genoma. Além disso, a DUPTREE permite que os usuários examinem enraizes alternativos e ponderem os custos de reconciliação para árvores genéticas. A DUPTREE é um projeto de código aberto escrito em C ++.
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