Clãs. Uma pequena ferramenta escrita em Java para análise de cluster de sequências.
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Clãs. Classificação e resumo

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Clãs. Descrição

Freqüentemente, a homologia é usada como motivo para transferir conhecimento sobre função ou estrutura de proteínas conhecidas por desconhecidas. Embora filogenias sejam o método de escolha ao tentar determinar a homologia, o marcador mais utilizado é semelhança de seqüência de pares. O problema de encontrar grupos de genes coextrados em vários experimentos de microarray é bastante semelhante ao problema de encontrar grupos de proteínas homólogas em um grande conjunto de dados. Em ambos os casos, temos enormes quantidades de dados e estamos procurando esses poucos genes que mostram algum tipo de similaridade significativa. A co-regulação putativa, bem como a homologia putativa são geralmente inferidas de semelhanças no conjunto de recursos de um gene. No primeiro caso, o conjunto de recursos consiste nos níveis de expressão nos termos dos experimentos, no segundo caso das seqüências de aminoácidos das proteínas. Uma determinada semelhança também é aparente quando você analisa os gráficos gerados para dados de sequência de proteína ou dados de microarray. Faça clãs e leve-o para um giro para ver o que pode realmente fazer por você!

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