Assimmetrycounter. Contagem de substituições em cada direção para pares de aminoácidos.
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Assimmetrycounter. Classificação e resumo

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Assimmetrycounter. Descrição

AssimetryCounter é um pequeno prompt de comando baseado especialmente projetado para assumir o arquivo de sequências alinhadas produzidas pela AmbiguityRemover e contagens, para cada par de aminoácidos, o número de substituições em cada direção. Compara a proporção de substituições em uma direção e substituições na direção oposta à relação esperada 1: 1 usando um teste de bondade de ajuste. Se um par de aminoácidos tiver menos de 50 substituições totais, o teste binomial exato é usado e o valor P é relatado; Se houver 50 ou mais substituições, o teste G de bondade de ajuste é usado e o valor G e o valor p são relatados. Se o valor G for maior que 454, o valor P é dado como "

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