Guugle.

Um utilitário para correspondência rápida e exata sob regras de emparelhamento de base RNA
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Guugle. Classificação e resumo

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  • Nome do editor:
  • Wolfgang Gerlach
  • Site do editor:
  • http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/guugle/
  • Sistemas operacionais:
  • Mac OS X
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Guugle. Descrição

Um utilitário para correspondência rápida e exata sob regras de pareamento de base RNA A análise de estrutura secundária de RNA geralmente requer a busca de potenciais hélices em grandes dados de seqüência. A Guugle é uma ferramenta baseada em linha de comando que localiza eficientemente potenciais regiões helicoidais sob regras de emparelhamento de base RNA, que incluem Watson-Crick, bem como pares G-U. Guugle aceita um alvo e um conjunto de consulta de sequências e determina todas as correspondências exatas em regras de RNA entre seqüências de destino e consulta que excedam um comprimento especificado. Se você precisar criar uma saída maior do que permitimos que o uso on-line ou queira incorporar Seu próprio pipeline, baixe o programa Guugle do Departamento de Download do Bibiserv.


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