Filographer. Filógrafo é um programa destinado a visualizar e estudar relacionamentos evolutivos dentro das famílias de genes homólogos.
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Filographer. Classificação e resumo

Filographer. Tag

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Filographer. Descrição

O filografista é um programa destinado a visualizar e estudar relacionamentos evolutivos dentro das famílias de genes homólogos. O filografista é um programa destinado a visualizar e estudar relacionamentos evolutivos dentro das famílias de genes homólogos ou proteínas (elementos). O filografista é uma ferramenta de desenho que gera gráficos personalizados para um determinado conjunto de elementos. Em geral, é possível usar o filografão para visualizar qualquer tipo de relações entre os elementos.Cada gene ou proteína no gráfico do feylografo é representado como um nó colorido (vértice) e conectado a outros nós (vértices) por linhas (bordas) de espessura variável e cor com base na semelhança de genes ou proteínas (matriz de distância). A posição de cada nó no gráfico é flexível e ajustada pelo usuário para otimizar a visualização das inter-relacionamentos entre os nós. Consequentemente, as distâncias físicas no gráfico entre os nós não têm conteúdo de informação diferente de árvores filogenéticas clássicas. O nível de similaridade entre genes ou proteínas nos gráficos do feylographer é indicado por cor e espessura de linha.filógrafo é escrito em TCL / TK e funciona no Unix / Linux ou Windows que suporta o kit de ferramentas TCL / TK. Os computadores Macintosh podem ter um problema em execução filmador por causa do mouse de um botão. As características críticas dos gráficos em geral são quais pontos são conectados pelos quais linhas. Os elementos básicos e características de um gráfico são seus: vérticulação (nó), borda Grau de um vértice (o número de bordas que o tocam), tamanho (número de vértices), caminho (uma rota do vértice para vértice), comprimento do caminho (número de bordas em um caminho), gráficos planários e não planários (Gráfico é planar se pode ser desenhado em um avião para que as bordas se cruzem apenas nos vértices), distância (caminho mais curto), diâmetro (distância maior entre dois vértices), vértice isolado (um vértice de grau zero), vértices adjacentes (conectado por uma borda), vintage (vértices adjacentes) e outros (você pode verificar nossa coleção de links da web). Uma árvore é um gráfico conectado que contém nenhum ciclos.Requirements: · TCL / TKWhat Novo nesta versão: · Pequena fixação de bugs (filografia não funcionou adequadamente se o ID do gene representado apenas em caracteres numéricos, e. Genbank Identifier ).

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